Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ercc3P49135 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ercc3P49135 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ercc3P49135 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms