Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cox8bP48772 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cox8bP48772 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms