Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ptx3P48759 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx3P48759 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms