Protein–RNA interactions for Protein: P48758

Cbr1, Carbonyl reductase [NADPH] 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr1P48758 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cbr1P48758 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbr1P48758 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms