Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TesP47226 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TesP47226 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TesP47226 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TesP47226 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TesP47226 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TesP47226 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TesP47226 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TesP47226 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TesP47226 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms