Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd4P46935 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nedd4P46935 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms