Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LifrP42703 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LifrP42703 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LifrP42703 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LifrP42703 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LifrP42703 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LifrP42703 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LifrP42703 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LifrP42703 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LifrP42703 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LifrP42703 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LifrP42703 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LifrP42703 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LifrP42703 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LifrP42703 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LifrP42703 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LifrP42703 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LifrP42703 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LifrP42703 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LifrP42703 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LifrP42703 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LifrP42703 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LifrP42703 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LifrP42703 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LifrP42703 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LifrP42703 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LifrP42703 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms