Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept1P42209 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sept1P42209 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept1P42209 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sept1P42209 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sept1P42209 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms