Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp9P41245 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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