Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rpl28P41105 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rpl28P41105 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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