Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VhlP40338 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VhlP40338 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VhlP40338 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VhlP40338 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VhlP40338 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VhlP40338 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VhlP40338 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms