Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf2P39429 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf2P39429 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf2P39429 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms