Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ptpn1P35821 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ptpn1P35821 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms