Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stfa1P35175 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stfa1P35175 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms