Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PvalbP32848 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PvalbP32848 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms