Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxa2P31245 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa2P31245 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms