Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ctnnd1P30999 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnd1P30999 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms