Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gjc1P28229 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjc1P28229 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms