Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxd12P23812 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd12P23812 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms