Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ggta1P23336 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms