Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gja1P23242 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gja1P23242 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gja1P23242 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms