Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PparaP23204 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PparaP23204 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PparaP23204 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PparaP23204 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PparaP23204 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PparaP23204 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PparaP23204 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PparaP23204 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PparaP23204 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PparaP23204 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PparaP23204 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PparaP23204 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PparaP23204 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PparaP23204 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PparaP23204 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PparaP23204 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms