Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd3eP22646 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd3eP22646 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms