Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ms4a2P20490 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ms4a2P20490 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ms4a2P20490 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms