Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F3P20352 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F3P20352 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F3P20352 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F3P20352 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F3P20352 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F3P20352 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F3P20352 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F3P20352 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F3P20352 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F3P20352 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F3P20352 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
F3P20352 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F3P20352 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
F3P20352 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F3P20352 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms