Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NefhP19246 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NefhP19246 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NefhP19246 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NefhP19246 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NefhP19246 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NefhP19246 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NefhP19246 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NefhP19246 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NefhP19246 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NefhP19246 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NefhP19246 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NefhP19246 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NefhP19246 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NefhP19246 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms