Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Csn1s1P19228 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Csn1s1P19228 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Csn1s1P19228 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Csn1s1P19228 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Csn1s1P19228 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csn1s1P19228 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms