Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ighv3-6P18531 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ighv3-6P18531 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms