Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18524 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18524 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18524 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18524 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18524 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18524 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18524 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18524 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18524 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18524 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P18524 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P18524 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P18524 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P18524 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P18524 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms