Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl2P10889 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl2P10889 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms