Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hoxb4P10284 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb4P10284 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms