Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UbbP0CG49 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms