Protein–RNA interactions for Protein: P0C7A0

Khdc1b, KH homology domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1bP0C7A0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Khdc1bP0C7A0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Khdc1bP0C7A0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms