Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf1P09925 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Surf1P09925 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Surf1P09925 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Surf1P09925 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms