Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxa1P09022 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa1P09022 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms