Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifna4P07351 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms