Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TtrP07309 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TtrP07309 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TtrP07309 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TtrP07309 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TtrP07309 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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TtrP07309 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TtrP07309 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TtrP07309 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TtrP07309 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtrP07309 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtrP07309 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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