Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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PtprcP06800 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprcP06800 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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PtprcP06800 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PtprcP06800 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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PtprcP06800 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprcP06800 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprcP06800 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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PtprcP06800 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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PtprcP06800 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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PtprcP06800 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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PtprcP06800 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PtprcP06800 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprcP06800 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms