Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa3P02831 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa3P02831 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms