Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxa7P02830 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa7P02830 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa7P02830 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms