Protein–RNA interactions for Protein: P01806

Ig heavy chain V region 441, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01806 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01806 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01806 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01806 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01806 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01806 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01806 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01806 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01806 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01806 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01806 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01806 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01806 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01806 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01806 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms