Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POP4O95707 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POP4O95707 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POP4O95707 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POP4O95707 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POP4O95707 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POP4O95707 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms