Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gnpda1O88958 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gnpda1O88958 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms