Protein–RNA interactions for Protein: O88952

Lin7c, Protein lin-7 homolog C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7cO88952 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7cO88952 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lin7cO88952 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms