Protein–RNA interactions for Protein: O88796

Rpp30, Ribonuclease P protein subunit p30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp30O88796 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpp30O88796 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rpp30O88796 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpp30O88796 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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