Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BlmO88700 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BlmO88700 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BlmO88700 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BlmO88700 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BlmO88700 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BlmO88700 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BlmO88700 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BlmO88700 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BlmO88700 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BlmO88700 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
BlmO88700 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BlmO88700 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BlmO88700 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BlmO88700 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BlmO88700 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BlmO88700 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BlmO88700 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BlmO88700 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BlmO88700 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BlmO88700 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BlmO88700 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BlmO88700 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BlmO88700 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BlmO88700 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BlmO88700 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BlmO88700 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms