Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx7O70439 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx7O70439 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx7O70439 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms