Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AurkbO70126 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AurkbO70126 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms