Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp2a2O55143 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2a2O55143 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms