Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpl35aO55142 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl35aO55142 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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